脳卒中後遺症は、脳血管障害（脳梗塞・脳出血）後に残存する運動麻痺、感覚障害、言語障害、嚥下障害、痙縮、肩手症候群などを包含する。日本における脳卒中患者数は約174万人で、要介護認定の最大原因疾患である。急性期治療の進歩により生存率は向上したが、後遺症によるADL低下は依然として大きな課題である。鍼灸治療は中国を中心に脳卒中リハビリテーションの補完療法として数千年の歴史を持ち、特に頭皮鍼（スカルプ鍼）や電気鍼による神経可塑性促進が注目されている。近年のfMRI研究では、鍼刺激が運動関連脳領域の再組織化を促進することが示されている。